סגל חברי המכון למדעי היהדות מורכב מהסגל האקדמי של חוגי המכון וכן מחברים מחוגים שונים בפקולטה למדעי הרוח באוניברסיטה העברית שבחרו להשתייך למכון.

• איה אלידע
• מרים גולדשטיין
• הלל כהן
• עוזי ליבנר
• אדווין סרוסי
• אלכסנדר קוליק
• אסף שלג 
• דני שרירא